モルックスで,アミノ酸の一つ,トレオニンをつくりましょう

イッセイです。モルックスを使って,トレオニンをつくりましょう。

目次

アミノ酸の共通構造をつくりましょう

私たちの体に含まれるタンパク質は,アミノ酸がつながった鎖の構造をしています。

タンパク質の材料になるアミノ酸には,20種類あります。

アミノ酸には共通構造があります。

Common structure
アミノ酸の共通構造

真ん中の4面体の炭素原子の頂点には,そのアミノ酸に特長的な原子たちがつきます。そこで,共通ではないのでジョイントをつけただけにしています。

奥に水素原子,右下に酢酸と共通の原子たち(カルボキシル基),左下に窒素と水素2この原子たち(アミノ基)がついています。

4面体の炭素に四種類の異なる原子たちがつく場合,右足と左足の靴みたいな似ているようで違う分子ができます。このような原子を不斉炭素原子と呼んでいます。

モルックスで分子模型をつくるときには,不斉炭素原子というものに注意しましょう

とても面倒ですが,生物は厳密に区別しているので,しかたありません。

モルックスの写真だけではわかりにくいので,原子ブロックを図にしてみました。

Common structure
図で示したアミノ酸の共通構造

原子ブロックにつけた数字は何面体かということでみてください。色は,原子ブロックの種類です。

黒は炭素,赤は酸素,青は窒素,白は水素です。

以下の順番で組み立てたら間違えないでしょう。

  1. 4面体の炭素原子を手に取る
  2. 頂点を意識して,持つ
  3. 向こう奥に水素をつける
  4. 右側にカルボキシル基をつける
  5. 左側にアミノ基をつける

トレオニンにしましょう

threonine
トレオニンの構造

トレオニンは,共通構造にエチルアルコールがくっついたような構造をしています。

そして,トレオニンには,共通構造にしかなかった不斉炭素原子が,側鎖の部分にもできています。

そこで,不斉炭素原子であることを赤い4で示しています。

threonine1
トレオニンの部品と共通構造

左上に2面体酸素に水素をつけたものを置いています。

真ん中に不斉炭素原子である4面体炭素原子に水素の原子ブロックを1つつけています。

右上の4面体炭素原子には,水素の原子ブロックを3つつけています。

下には共通構造をおいています。

真ん中の炭素の原子ブロックを写真のように置いておいてから,左右を間違えないようにくっつけると側鎖の完成です。

threonine2
トレオニンの側鎖と共通部分

これで側鎖の部分の完成です。

共通部分と側鎖をくっつけると,トレオニンの完成です。